O seqüenciamento de genoma inteiro pode corresponder a mais pacientes com câncer de mama para terapias e ensaios personalizados

O sequenciamento de genoma inteiro oferecido a pacientes com câncer de mama provavelmente identificará características genéticas únicas que podem orientar o tratamento imediato ou ajudar a combinar pacientes com ensaios clínicos, dizem cientistas da Universidade de Cambridge. Sua pesquisa é publicada em A oncologia Lancet.

Em 2022, 2,3 milhões de mulheres foram diagnosticadas com câncer de mama em todo o mundo e houve 670.000 mortes relacionadas. Apesar do progresso significativo nos últimos anos, continua sendo um desafio identificar com precisão os melhores tratamentos para pacientes individuais e prever casos com pior prognóstico.

O sequenciamento de genoma inteiro é uma técnica poderosa que envolve analisar o DNA do paciente e do tumor para procurar mudanças genéticas ou mutações. Isso fornece informações sobre a causa subjacente do tumor e o que está dirigindo. Ele também pode fornecer informações valiosas para orientar o tratamento, por exemplo, identificando vulnerabilidades na maquiagem do tumor ou na detecção de sinais de que um paciente pode ser resistente a um tratamento específico.

Embora a tecnologia esteja rapidamente se tornando mais barata – a Grima Genomics anunciou recentemente que pode sequenciar um genoma humano por US $ 100 – ela não é amplamente utilizada no Serviço Nacional de Saúde (NHS) do Reino Unido. Oferecido pelo Serviço de Medicina Genômica do NHS, atualmente está disponível para alguns cânceres adultos, câncer raro, câncer pediátrico e certos cânceres metastáticos.

A professora Serena Nik-Zainal, do Departamento de Medicina Genômica e Instituto de Câncer da Universidade de Cambridge, disse: “Está se tornando cada vez mais possível usar o sequenciamento de genoma inteiro para informar o gerenciamento do câncer, mas não está sendo usado em todo o seu potencial, e certamente não para alguns dos tipos mais comuns de câncer.

“Parte da razão pela qual é porque não temos os estudos clínicos para apoiar seu uso, mas também é em parte precisamente porque as informações são muito ricas – em um sentido, as informações podem ser muito impressionantes para entender”.

Para ajudar a enfrentar esses desafios, o professor Nik-Zainal e colegas usaram dados de quase 2.500 mulheres de toda a Inglaterra, alojadas na Biblioteca Nacional de Pesquisa Genômica-uma das maiores e mais valiosas ativos de dados do mundo do gênero e administrado pela Genomics England. Os dados das 2.500 mulheres vieram do seu recrutamento para o projeto de 100.000 genomas e foram vinculados a registros clínicos e/ou de mortalidade, rastreando resultados ao longo de cinco anos.

Os pesquisadores procuraram mudanças genéticas que causam ou influenciam o câncer de mama, incluindo problemas na maneira como as células reparam o DNA.

A equipe descobriu que 27% dos casos de câncer de mama tinham características genéticas que poderiam ajudar a orientar o tratamento personalizado imediatamente, seja com medicamentos existentes ou recrutamento para ensaios clínicos prospectivos ou atuais. Isso equivale a mais de 15.000 mulheres por ano no Reino Unido.

Entre esses recursos identificados estavam: DRH (deficiência de reparo dirigida por homologia), um problema de reparo de DNA encontrado em 12% de todos os cânceres de mama; mutações únicas que poderiam ser direcionadas com medicamentos específicos; sinais de resistência à terapia hormonal; e padrões mutacionais que sugerem fraquezas no câncer que os tratamentos podem explorar.

A equipe identificou 15% adicionais dos casos que tinham recursos que poderiam ser úteis para pesquisas futuras, como problemas com outras vias de reparo de DNA. Isso equivaleria a mais de 8.300 mulheres por ano.

A análise também forneceu informações sobre o prognóstico. Por exemplo, no subtipo mais comum de câncer de mama, conhecido como câncer de mama ER+HER2-, que representam aproximadamente 70% dos diagnósticos, havia fortes indicadores genéticos de quão agressivo o câncer pode ser. Por exemplo, as principais alterações estruturais do DNA estavam ligadas a um risco muito maior de morte, assim como as assinaturas mutacionais de Apobec (um tipo de padrão de dano ao DNA) e mutações no gene do câncer TP53. Esses marcadores genéticos eram mais preditivos do que medidas tradicionais, como idade do paciente, estágio do câncer ou grau de tumor.

Usando os resultados, os pesquisadores criaram uma estrutura para ajudar os médicos a identificar quais pacientes precisam de tratamento mais agressivo e quais podem ter menos tratamento. Também sugeriu que cerca de 7.500 mulheres por ano com tumores de baixo grau podem se beneficiar de tratamento mais agressivo.

Professor Nik-Zainal said, “The UK is a genuine world-leader in terms of its ability to do whole genome sequencing in the NHS through the Genomic Medicine Service. Now that we have population-level evidence of how impactful whole-genome sequencing could be, we have the potential to make a difference to thousands of patients’ lives every year, helping tailor their care more precisely, giving more treatment to those who need it and less to those who don’t.”

Além de ser usado para adaptar os tratamentos a pacientes individuais, os dados de sequenciamento de genoma inteiro podem ajudar a transformar a maneira como recrutamos e executamos ensaios clínicos, acelerando o desenvolvimento de novos tratamentos necessários.

Professor Nik-Zainal added, “At the moment, we test patients for just a small number of genetic mutations and may invite them to join a clinical trial if the patient has a mutation that matches the trial’s target. But if we have their entire genetic readout instead, we will no longer be restricted to single trials with a specific target. We could massively open up the potential for recruitment to multiple clinical trials in parallel, making recruitment to clinical trials more efficient, ultimately getting as terapias certas para os pacientes certos muito mais rápido “.